环境技术研究室主要从事放射性废物处理和处置工艺、工业固体废物及危险废物的处理和处置技术，工业废水和生活污水处理及回用技术、生活饮用水净化新技术的开发，反应堆厂房及放射性厂房的通风系统设计、洁净厂房和实验室的空气净化研究，滤料及过滤器效率检测，以及辐射技术分解持久性有机污染物等方面的研究。环境技术研究室拥有暖通实验室、放射性废水处理及固化实验室、钴源实验室和水处理实验室，总建筑面积1450平方米。暖通实验室设有自行研制成功的钠焰法高效过滤器效率检测装置和钠焰法高效滤料效率检测台。放射性废水处理及固化实验室是低放废水处理和中放废液固化的车间，设有包括蒸发器和离子交换系统的放射性废水处理系统。钴源实验室于1988年建成，是主要从事辐射化学研究用的小型辐照装置，并对外承接少量来料辐照加工，现装源量为3万居里。此外，该室还设有仪器分析和化学分析实验室。